聊城市疾病预防控制中心是2004年在原聊城市卫生防疫站基础上更名成立的，是聊城市政府对社会实施疾病预防控制与公共卫生技术管理和服务的公益一类事业单位，是全市疾病预防控制工作的业务技术指导中心。
中心职能
一、开展疾病预防控制、突发公共卫生事件应急、环境健康、职业健康、营养健康、老龄健康、妇幼健康、放射卫生和学校卫生等工作，为我市制定公共卫生法律法规、政策、规划、项目等提供技术支撑、情报信息、综合研判和咨询意见；承担市委重大疾病和传染病防治工作领导小组办公室有关工作。
二、开展传染病、慢性病、职业病、地方病、突发公共卫生事件和疑似预防接种异常反应监测预警及国民健康状况监测与评价，开展重大公共卫生问题的调查与危害风险评估；研究制定重大公共卫生问题的干预措施并组织实施。
三、组织实施全市疾病预防控制技术、对策和措施，承担全市疾病预防控制信息的收集、分析、评价、反馈及疫情预测、预报工作；开展各种传染病溯源和流行病学调查，承担突发公共卫生事件和灾害应急处置等工作；强化对市属医疗机构和县(市、区)疾控中心及时报送疾病信息的指导监督，健全制度机制，加强协同联动，打造专业化、现代化的疾病预防控制与临床救治网络，重大疫情信息和突发公共卫生事件直接向市委重大疾病和传染病防治工作领导小组报告。
四、指导市级医疗机构和县(市、区)开展突发公共卫生事件调查、应急处置，联系协调高层次专家参加突发公共卫生事件监测、预警和处置工作。
五、开展疾病和传染病预防控制、突发公共卫生事件应急、公众健康理论及技术相关临床研究、指导，以及相关科研成果的开发、应用、推广等。
六、负责公共卫生健康危害因素监测与干预，组织开展食源性、职业性、放射性、环境性等疾病的监测评价。
七、承担健康教育、健康科普与健康促进职责，开展公众健康和营养状况监测与评价，提出干预策略与措施。
八、开展疾病和传染病病原生物检测、鉴定和物理、化学因子检测、分析、评价工作；受委托开展疾病和传染病预防控制、公共卫生相关技术服务。
九、承办市卫生健康委交办的其他事项。
科所设置
设管理科室6个，业务科室18个及工会、妇委会、团委3个群团组织。
管理科室：办公室（网络信息中心）、人事科（科研教育科）、财务科、业务管理科（应急管理办公室）总务与安全保卫科、设备与物资管理科（生物制品管理办公室）。
业务科室：病毒性传染病预防控制所、细菌性传染病预防控制所、免疫预防管理所、艾滋病防制所、慢性非传染性疾病防制所、地方病与寄生虫病防制所、食品与营养所、环境卫生监测评价所、职业卫生监测评价所、辐射防护安全所、学校卫生所、消毒与病媒生物防制所、理化检验所、健康教育所、质量管理科、农村与社区公共卫生指导所、预防医学研究室、消杀服务站。
基础建设
建筑面积9417平方米，实验室面积4000平方米，固定资产7149万元，检测仪器总值4100万。
能力建设
人员构成：聊城市疾病预防控制中心编制197人，现有在职在编人员115人，其中博士1人，研究生26人，本科63人，高级专业技术人员20人，中级49人。
资质建设：中心现有国家致病菌识别网聊城市网络实验室、艾滋病确证实验室、国家级流感监测网络实验室、麻疹监测网络实验室、职业病危害因素检测实验室、公共场所检测分析实验室、地方病检测实验室7个专业实验室及大型综合理化检验实验室。另外，两个聊城市重点实验室：聊城市疑难细菌鉴定重点实验室和聊城市食品安全风险评估重点实验室。
先后取得检验检测机构资质认定（CMA）资质、职业卫生技术服务机构乙级资质、麻疹监测网络实验室、国家致病菌识别网聊城市网络实验室、全国流感监测网络实验室、国家食品安全风险监测山东中心聊城分中心等6类专业资质，通过省级实验室资质认定项目为23个产品及128个产品中1762个参数。
业务建设：现拥有省级重点学科1个，国家级实验室3个，省级区域中心实验室1个；中心现有院士工作站和博士后创新实践基地高端科研平台，是山东大学、泰山医学院、潍坊医学院、济宁医学院等高等院校的实践教学基地。有全市百人计划“杏林名医”1人、聊城市突出贡献中青年技术专家2人、“水城英才”1人。
历年荣誉
中心先后荣获全国医药卫生系统先进单位、思想政治工作先进单位、富民兴鲁劳动奖状、全国五一劳动奖状等荣誉称号，2020年中心疫情防控检验团队被市委宣传部授予聊城战“疫”最美集体，中心党委被中共山东省委、山东省人民政府授予“山东省抗击新冠肺炎疫情先进集体”，被中共山东省委授予“山东省先进基层党组织”称号。